Preise / Auszeichnungen (Auswahl):
F.I.C.C.-Preis Leipzig, 1993 für „Balagan“
Deutscher Filmpreis, Filmband in Silber, 1994
Berlinale, Friedensfilmpreis, 1994
Otto-Sprenger-Preis, Hamburg, 1994
Deutscher Filmpreis (Nominierung), 1996 für „Die Überlebenden“
Hauptpreis Int. Dokumentarfilmfestival München -
Dokumentarfilmpreis des Bayerischen Rundfunks 1996
Adolf-Grimme-Preis, 1998
Hessischer Filmpreis, 2001 für „Black Box BRD“
Europäischer Filmpreis, 2001
Bayerischer Filmpreis, 2002
Goldene Filmspule, Weingarten, 2002
Deutscher Filmpreis in Gold, 2002
Best Film, Santa Barbara International Film Festival, 2002
Berlinale Publikumspreis 2004 für „Die Spielwütigen“
Hauptpreis Int. Dokumentarfilmfestival München
Dokumentarfilmpreis des Bayerischen Rundfunks 2004
Europäischer Filmpreis (Nominierung), 2004
Preis der Deutschen Filmkritik 2005
Baden-Württembergischer Dokumentarfilmpreis 2005
Konrad-Wolf-Preis der Akademie der Künste, 2005
Friedrich-Luft-Preis, Berlin, 2006 für die Inszenierung „Der Kick“
New Berlin Film Award, 2006 für „Der Kick“
Grand Prix, Filmfestival Visions Du Reel, Nyon, 2006
DEFA-Preis zur Förderung der Deutschen Filmkunst, 2006
Film des Jahres 2006 für ''Der Kick'' (Evangelische Jury)
Robert-Geisendörfer-Preis für ''Der Kick'' 2007
Grimme-Preis (Nominierung) für ''Der Kick'' 2008
Deutscher Jugendliteratur-Preis 2008
Thomas-Strittmatter-Drehbuchpreis 2009 (Nominierung) für „Wer wenn nicht wir“
Berlinale Wettbewerb 2011 Alfred Bauer Preis
Preis der Gilde Deutscher Filmkunsttheater
Deutscher Filmpreis ''Bester Spielfilm'' in Bronze 2011
Metropolis Regiepreis (Nominierung Bester Regisseur)
Hessischer Filmpreis 2011: Bester Spielfilm
Poona International Film Festival: Bester Spielfilm
Sevilla: Best European Film (Silver) 2011
Santo Domingo International: Bester Spielfilm
Hörfilmpreis: Bester Kinospielfilm 2012
Ernst-Schneider-Preis für Sie nennen es Sterbehaus in Die Zeit. 30. Oktober 2015
Deutscher Journalisten Preis 2016
Bundesverdienstkreuz Erster Klasse 2017
Gilde-Filmpreis, Kategorie bester Dokumentarfilm für Beuys 2017
Deutscher Filmpreis in Gold (Bester Dokumentarfilm) 2018
Bestes Drehbuch (Nominierung), Deutsche Akademie für Fernsehen für Ökozid 2021